國務院港澳辦及中聯辦，對三名海關關員殉職表示沉痛哀悼，對遇難者家屬和受傷人員表示深切慰問。 中聯辦相關部門負責人，曾到屯門醫院看望死者家屬。 而海關官員協會表示，昨晚是部門經歷的最沉重一夜，對事件表達沉痛哀悼及難過。深深體會殉職同袍家人和同事的痛楚和哀傷，致以最深切慰問，希望他們節哀順變，盡快走出傷痛。同時希望受傷同袍早日康復、平復心情，協會會盡一切努力提供適切援助。
