對於有報道指，珠江口的中華白海豚數量，因港珠澳大橋工程減少兩成。大橋管理局表示，建造過程中一直有監察，亦有進行保育，相信白海豚不會因為工程「搬家」。 港珠澳大橋管理局副局長余烈表示：「水上的工程建設完了以後，不再產生懸浮污染，也不再產生震動噪音，所以白海豚陸陸續續回到這個地方來，環境又會恢復。而且因為人工島的建築，形成了很多魚礁、有些生態白海豚的餌料，有一些有利繁殖。」
